为了保护人类免受未知的电脑病毒“崩源体病毒感染症”的感染与危害，假面骑士Ex-Aid（饭岛宽骑 配音）与来自电脑网络的敌人持续展开战斗。这一日，脱胎自经典电脑游戏《吃豆人》的游戏病毒生命体“吃豆人”突然袭来，人类世界陷入空前的危机。令人意想不到的是，该病毒危害性极其之大，甚至假面骑士Ghost的本体天空寺尊（西铭骏 饰）都受到感染，丧失了变身的能力。宝生永梦尝试查到神秘对手的真实身份，结果发现令他震惊的事实。在此期间，天空寺尊和宝生永梦都被逼入危险的境地。危急时刻，历代传奇假面骑士Brave（濑户利树 饰）、Specter（山本凉介 饰）、Snipe（松本享恭 饰）乃至Wizard（白石隼也 饰）、Drive（竹内凉真 饰）等相继现身。传奇战士齐聚一堂，为了人类的未来携手奋战！ 　　本片“假面骑士系列”诞生45周年纪念作品。

为了保护人类免受未知的电脑病毒“崩源体病毒感染症”的感染与危害，假面骑士Ex-Aid（饭岛宽骑 配音）与来自电脑网络的敌人持续展开战斗。这一日，脱胎自经典电脑游戏《吃豆人》的游戏病毒生命体“吃豆人”突然袭来，人类世界陷入空前的危机。令人意想不到的是，该病毒危害性极其之大，甚至假面骑士Ghost的本体天空寺尊（西铭骏 饰）都受到感染，丧失了变身的能力。宝生永梦尝试查到神秘对手的真实身份，结果发现令他震惊的事实。在此期间，天空寺尊和宝生永梦都被逼入危险的境地。危急时刻，历代传奇假面骑士Brave（濑户利树 饰）、Specter（山本凉介 饰）、Snipe（松本享恭 饰）乃至Wizard（白石隼也 饰）、Drive（竹内凉真 饰）等相继现身。传奇战士齐聚一堂，为了人类的未来携手奋战！ 　　本片“假面骑士系列”诞生45周年纪念作品。

身份不明的游戏病毒生命体来袭，人类将陷入前所未闻的危机。以恐怖的趋势扩大感染中，天空寺尊（假面骑士灵骑）也因为感染上这种病毒，失去了变身的能力。另一方面宝生永梦（假面骑士艾克赛德）追查敌人的真面目及感染源，但那正左右他自身的命运的“重大的真实”有着连系关系。被堵住去路的艾克赛德与灵骑。 谁能在这穷途末路的危机下拯救这两名假面骑士及人类们，那么，只有那些男人们。

身份不明的游戏病毒生命体来袭，人类将陷入前所未闻的危机。以恐怖的趋势扩大感染中，天空寺尊（假面骑士灵骑）也因为感染上这种病毒，失去了变身的能力。另一方面宝生永梦（假面骑士艾克赛德）追查敌人的真面目及感染源，但那正左右他自身的命运的“重大的真实”有着连系关系。被堵住去路的艾克赛德与灵骑。 谁能在这穷途末路的危机下拯救这两名假面骑士及人类们，那么，只有那些男人们。

身份不明的游戏病毒生命体来袭，人类将陷入前所未闻的危机。病毒以恐怖的趋势扩大感染中，天空寺尊（假面骑士灵骑）也因为感染上这种病毒，失去了变身的能力。另一方面宝生永梦（假面骑士艾克赛德）追查敌人的真面目及感染源，但艾克赛德与灵骑却在关键时刻被敌人堵住了去路。在这穷途末路的危机下，这两名假面骑士及人类们都等待着英雄的出现，那些被称为传说的假面骑士们挺身而出，联手抗敌，共同打破了这一危机。

1971年时，邪恶的修卡组织命令科学家百濑龙之介做实验，将人类改造成怪物。龙之介不愿再助纣为虐，于是修卡组织利用龙之介释放出恶魔迪亚波罗后，将其流放至宇宙，龙之介意外通过黑洞穿梭至2071年的未来世界，发现那时世界已经由恶魔迪亚波罗掌控，为了拯救世界，他使用回旋加速驱动器来到了2021年，打算与自己的儿子秀夫合作，对抗迪亚波罗。但秀夫不愿原谅抛妻弃子的父亲，局面陷入了僵持。五十岚一辉、神山飞羽真、狩崎还有各位假面骑士，纷纷挺身而出对抗邪恶势力。秀夫最终也被亲情感化，原谅了父亲龙之介，父子俩成功变身为假面骑士世纪。各位骑士穿梭于未来与现在，为了守护世界而战，迪亚波罗最终被消灭，龙之介与秀夫间也不再有隔阂。

为调查某起神秘事件，葛叶紘汰（佐野岳 饰）潜入诡异凶险的海姆冥界之森调查。途中，他目击一位少年遭到巴丹帝国的怪人袭击。当他正打算变身铠武之际，有…

2016年，由于开始侵蚀世界的怪人“BugStar”=未知的电脑游戏病毒侵蚀开始。为了救助感染者，决定与BugStar战斗的天才玩家宝生永梦变身为假面骑士Ex-Aid。